A Cylonokat az ember teremtette. Azért készültek, hogy megkönnyítsék az életet a 12 Kolónián. De aztán eljött a nap, amikor a Cylonok eldöntötték, megölik gazdáikat. Hosszú és véres küzdelem után fegyverszünet született. Felépült egy távoli űrállomás, ahol a Cylonok és az emberek találkozhattak, és fenntarthatták diplomáciai kapcsolataikat. A Kolóniák minden évben küldenek egy tisztet. A Cylonok nem küldenek senkit. Senki sem látott vagy hallott Cylonokról több mint 40 éve.

De most kinyílik az ajtó, s Cylonok jelennek meg benne, velük egy vonző szőke nő.
- Te élsz? – kérdezi a Kolóniák megbízottjától.

- Igen. – válaszolja döbbent arccal a tiszt.

- Bizonyítsd be. – mondja neki a nő és megcsókolja.

A hajót közben találat éri, s elpusztul. Valami a kezdetét vette…

A Battlestar Galactica fedélzetén turisták járnak, a hajó már több mint 50 éves. A hajó a leszerelésre és múzeummá átalakításra készül. Adama parancsnok ünnepi beszédét gyakorolja.  A szerelői gárdának egy különleges ajándéka van a parancsnoknak. Egy eredeti Mark 2-es Nebula 7242 Constellation. Repülni fog az ünnepségen is. Emellett egy képet is adnak William Adamanak, amin ő és a fiai látszanak. Egy kártyajáték során verekedés robban ki Starbuck vadászpilóta és Tigh ezredes között. A lányt fogdába zárják.

Capricán Laura Roslin oktatásügyi miniszterről kiderül, hogy végzetes mellrákban szenved. Majd egy hajó fedélzeten a Galactica felé veszi útját, ahol hivatalos az ünnepségre. Egy gyönyörű, szőke hajú nő (Six) sétál a piacon. Egy általa törékenynek tűnő gyermeknek elveszi az életét… Egy tévéműsorban Dr. Gaius Baltar, a kor egyik legnagyobb tudósa szerepel. „A mesterséges intelligencia fejlesztésének és kutatásának a tiltása a Cylon Háborúk maradványa.”  Vagyis nem ért egyet azzal, hogy tiltani kellene mesterséges intelligenciák létrehozását. Megjelenik nála a szőke nő, akiről kiderül, hogy a barátnője és szeretkezés közben világít a háta…

A Battlestar Galactica fedélzetére érkezik Apollo százados is, akiről kiderül, hogy William Adama fia. Egy Raptorral leszáll Boomer és Helo is. Lee Adama fogja vezetni azt a Vipert, amivel majdnem 40 éve az édesapja is repült.

Capricán Gaius és Six sétálgat. Kiderül, hogy a nő fontos szerepet játszott a védelmi rendszer megszervezésében. Six arról akarja meggyőzni a férfit, hogy szereti őt és létezik egy igaz Isten, akinek a kívánságait teljesíti.

Roslin és Billy is megérkezik a Galacticára. A fiúnak sikerül is eltévednie, ennek köszönhetően megismerkedik Duallaval, aki első látásra megtetszik neki. A miniszter és a parancsnok beszélgetéséből kiderül, hogy sok mindenben nem értenek egyet. A nő szerint hálózatba kellene kötni a számítógépeket. Apollo meglátogatja a cellában Starbuckot. Legutóbb Lee öccsének, Zaknek a temetésén találkoztak. Lee az apját vádolja a testvére halála miatt.

Six rajtakapja Gaiust, hogy megcsalta. De nem tesz semmit, mondani akar valamit…

Doral üdvözli Apollot a fedélzeten. A két Adamaval csináltat közös képet, akik viszont fagyosan bánnak egymással. Végül az apa egy kávére hívja a fiát. Ismét összevesznek. Kiderül, hogy Zak nem volt jó pilóta, az apja segítsége nélkül az iskolába se jutott volna be. Épp ezért haragszik Lee ennyire az apjára.

Gauis megtudja Sixről, hogy egy Cylon. De a férfi ezt nehezen tudja elhinni, hisz legutóbb még kenyérpirítókra hasonlítottak a Cylonok. Magában Gaius is tudja, hogy a nő igazat mond. „És azért is hiszel nekem, mert hízeleg az egódnak, hogy a Tizenkét Kolónia sokmilliárd emberéből egyedül téged választottak a küldetésemhez.” Gaius megérti, miért is akart a nő a védelmi főrendszerekhez férni, „…egy pár óra múlva senki nem marad, aki megvádolhatna bármivel. Az emberiség gyermekei hazatérnek… még ma.”

A Galacticán az ünnepség tart. Adama parancsnok mond beszédet az összegyűlteknek: „A Cylon háború már rég véget ért, de mégsem szabad elfelejtetnünk az okokat, amiért oly sokan oly sokat áldoztak fel a szabadság nevében. Az egyenruha viselésének ára magas lehet, de… néha túl magas. Tudják, amikor a Cylonok ellen harcoltunk, azért tettük, hogy megmeneküljünk a kihalástól. De sosem tettük fel a kérdést, miért? Mi, mint nép, miért vagyunk érdemesek a megmentésre? Még mindig követünk el gyilkosságot kapzsiságból, gyűlöletből, féltékenységből. És még mindig látjuk minden bűnünket a gyermekeinken. Megtagadjuk a felelősségvállalást bármiért, amit tettünk. Ahogy a Cylonokkal is tettük. Úgy döntöttünk, Istent játszunk, életet teremtünk. És amikor az az élet ellenünk fordult, megnyugtattuk magunkat annak tudatában, hogy igazából nem a mi hibánk. Nem játszhatunk Istent, és utána kezeinket nem moshatjuk a dolgok miatt, amiket teremtünk. Előbb vagy utóbb eljön a nap, amikor többé már nem bújhatunk el a tetteink elől.”

Eközben a bolygón megkezdődik a támadás. Dr. Baltar magába roskad, nem tudja, hogy mit tegyen. Nem akar meghalni.

A Galactica is megtudja, hogy a Cylon támadás megkezdődött. „Percekkel ezelőtt szereztünk tudomást róla, hogy Cylon támadás indult anyabolygóink ellen. Nem ismerjük az ellenséges erők nagyságát, megoszlását, erejét. De minden jel arra mutat, hogy egy masszív támadás indult a Kolóniák védelmi erői ellen… ettől a pillanattól kezdve háborúban állunk. Önöket kiképezték erre. Önök készen állnak erre.” Karát is kiengedik. A Galactica pilótái szembeszállnak a Cylonokkal. A múzeumba való darabokat is előszedik, hogy legyen mivel megvédeni magukat. A Viperek összecsapnának a Cylonokkal, de a gépek megbénulnak, és a pilótákat sorba lövik le.

Boomeréket is megtámadják, a hajó megsérül. Muszáj leszállniuk Capricán.

A miniszterasszony beszélni akar a Colonial Heavy kapitányával. Roslin vezetésével elkezdik a hajót átszervezni a menekültek fogadása miatt. A feltétel nélküli megadást se fogadták el a Cylonok. Ellenséges hajók tűnnek fel a monitoron. Apollo megmenti a hajót és annak az utasait.

Capricán Helo és Boomer a Raptort javítják. Menekültek érkeznek hozzájuk, köztük van Dr. Gaius Baltar is.

Doral Apollóra akarja bízni a Colonial Heavy vezetését. De Roslin jól kézben tartja a helyzetet, mentőhajót csinál az utasszállítóból, és elkezdik összeszedni a túlélőket.

Helo alig tudja távol tartani a hajótól az embereket. A gyerekeket végül felengedik a hajókra, és kisorsolnak még embereket, akik felszállhatnak. Baltar nincs közöttük, de mikor Helo meglátja őt, átadja neki a helyét, hogy egy tudós is megmeneküljön. A Raptor pedig elindul.

A Galacticának már csak a múzeumi Mark 2-esi maradtak, ezeket küldik a Cylonok ellen. A gépek az újabb modellekkel szemben működnek a Cylon Raiderek ellen. De rengeteg más baj van velük, de legalább harcolni tudnak. Kara vezetésével elpusztítják a támadókat. A Galactica súlyos sérüléseket szenved. Tigh személyesen irányítja a javítási munkálatokat. Az ezredes lezáratja a részleget és kiadja a légtelenítési parancsot, ami 85 ember életébe kerül.  

A narancs dosszié értelmében kell cselekednie Laura Roslinnak. Ez azt jelenti, hogy az elnök, az alelnök és a kabinet nagy része halott. Az oktatásügyi miniszter 43. a sorban… Végül felesketik a Kolóniák Elnökének.

A Battlestar Galacticanak fegyverekre van szüksége. Van egy raktár a Ragnar kikötőben, arra veszik az irányt. Tyrol főnök teljesen kiakad az XO-ra, állítása szerint csak 40 másodperc kellett volna, és eloltják a tüzeket. De a kapitány kiáll Tigh mellett. A Battlestarok pusztulása után William Adama, a Battlestar Galactica parancsnoka átveszi a teljes flotta irányítását. Összetűzésbe kerül az Elnökasszonnyal, mert ő ellentámadást akar vezetni, míg Roslin a túlélőket akarja menteni. Cylon vadászok közelítenek a Coloniel One felé. Apollonak van egy ötlete. Hatalmas robbanás látszódik a Galactica fedélzetén, a Coloniel One-nak nincs nyoma…